Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PparaP23204 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PparaP23204 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms