Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TP20293 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TP20293 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TP20293 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TP20293 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TP20293 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TP20293 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TP20293 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TP20293 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TP20293 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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