Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms