Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18533 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18533 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18533 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18533 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms