Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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PcnaP17918 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PcnaP17918 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PcnaP17918 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PcnaP17918 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PcnaP17918 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PcnaP17918 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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