Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms