Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms