Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms