Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms