Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms