Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Itgb1P09055 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Itgb1P09055 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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