Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04213 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04213 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04213 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04213 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms