Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp2O88554 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms