Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms