Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timm44O35857 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms