Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag2O35638 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms