Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk2O35491 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Clk2O35491 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Clk2O35491 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Clk2O35491 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Clk2O35491 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms