Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms