Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms