Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1aO35134 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms