Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ArxO35085 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ArxO35085 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ArxO35085 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ArxO35085 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ArxO35085 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ArxO35085 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms