Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcshO08795 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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