Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx2O08686 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms