Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm379J3QQ19 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm379J3QQ19 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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