Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm19127-201ENSMUST00000207067 2445 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ly6c2-201ENSMUST00000100542 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms