Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer2J3QPU5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms