Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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