Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms