Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3415J3QMS8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3415J3QMS8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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