Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm3336J3QMQ6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm3336J3QMQ6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm3336J3QMQ6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm3336J3QMQ6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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