Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm21818J3KMS6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21818J3KMS6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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