Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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