Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms