Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm17455G3UW87 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17455G3UW87 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm17455G3UW87 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm17455G3UW87 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm17455G3UW87 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm17455G3UW87 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17455G3UW87 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms