Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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