Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm8005F6YKY3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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