Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms