Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Herc6F2Z461 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Herc6F2Z461 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms