Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms