Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ddx60E9PZQ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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