Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms