Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms