Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms