Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3543D3Z235 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms