Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn24D3YXJ9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn24D3YXJ9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms