Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17333C6EQI3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms