Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Otud7bB2RUR8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Otud7bB2RUR8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Otud7bB2RUR8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Otud7bB2RUR8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms