Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H60cB1B213 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H60cB1B213 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms