Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms