Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r232A2RTT5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms